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防治措施针对芝棒污染原因和引发途径，生产上，要掌握灵芝品种的特征特性，提供适宜其生长的环境条件，规范操作，并贯彻为主的方针，避免或减少芝棒感染杂菌。选用优良品种，对退化品种进行提纯复壮选用抗病性强、生活力强、高纯度的菌种进行接种。经多年试验示范，以采收子实体为主的菌株“日本赤灵芝”，采芝、收粉兼用型菌株“黄山8号”两个优良菌株较适宜我省气候特点及段木熟料灵芝栽培模式，由于栽培多年，该两个品种有退化趋势，需进行提纯复壮。科学安排栽培季节根据中原地区气候特点，短段木灵芝菌棒制作期选在11月上旬至翌年2月上旬为宜，在此时段内，为让菌丝有足够的发菌时间，宜利用当地气候资源，提早制作菌棒。
当料温降至40°C时，移入接种袋或接种箱中，然后放入酒精、棉塞、包扎带、气雾消毒盒、火机、接种钩、菌种，菌种好用百菌清或5%水浸洗，同时有红、绿、黄等色杂菌的菌种，每四筒料放一包菌种。一切就绪后封闭接种箱，点燃消毒盒20分钟后可实现接种，接种时操作人员预先用75%酒精消毒双手，然后小心伸入接种箱中，从尾部撕开种袋接种，种头接近棉塞处的表皮种 弃之不用。地养室培养，此时培养室温度保持24~30°C,12小时后种子开始萌发吃料，20天后当菌丝长至筒料一半时，把接种端袋口稍稍打开通气培养，菌丝长满后，零星出现原基时，进入菌棚排场管理。
我国是世界上三大锻木（原木）灵芝产区之一（另有韩国、日本），产量占世界总产量的50%以上。浙江从1989年开始灵芝人工栽培试验并取得成功，1992年农民利用纯锻木仿生法大规模栽培灵芝，产业化经营至2007年，平均每年锻木投放量3000立方米（高时达7000立方米），年产干灵芝150吨，占全国总量的四分之一。2008年以来浙江省中药产业协会将灵芝重点扶持产业，市场上灵芝产品越来越多，包括灵芝子实体、抱子粉、菌丝体为主要成分的和药品，广泛应用于肿瘤、冠心病、心绞痛、高脂血症、高血压病、、慢性支气管炎和哮喘、神经衰弱、肝炎等。但国内外灵芝药材及其产品均无系统的质量控制体系，对灵芝及其产品质量的控制大多都停留在主要活性成分定性评价的水平上，灵芝品种使用也是几十年一成不变，单一品种的重复使用，菌种种性退化明显，与“、有效、稳定、可控叩勺中药现代化、国际化要求存在相当差距，建立灵芝功效成分定性与定量结合的评价方法，控制灵芝及其产品质量，对灵芝产业可持续发展具有重要意义。
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